La elaboración de PANGEOS-MX se desarrolló en dos etapas.

1. Estudio transversal retrospectivo a través del análisis de fuentes secundarias de datos de morbilidad y mortalidad, uso de servicios e infraestructura disponible para la atención a trastornos mentales, uso de sustancias y lesiones.

   Esta fase implicó la extracción, limpieza, análisis y transformación de la información pública de más de 80 bases de datos históricas contenidas en los distintos subsistemas de información en salud.

   Este procesamiento se llevó a cabo por cada uno de los componentes:

   1. Mortalidad: Se analizó un total de 13.6 millones de registros provenientes del ceriticado de defunción con información de 61 variables.
   2. Egresos hospitalarios: Se fusionaron 21 bases de datos generales de egresos hospitalarios, con 11 bases de datos que concentran todas las afecciones detectadas durante la hostitalización y con 11 bases de datos que describen los procedimientos médicos realizados durante la estancia hospitalaria de las personas. En total se procesoaron más de 100 millones de registros con poco más de 100 variables.
   3. Infraestructura. Se fusionaron las bases de datos correspondientes a recursos humanos e infraestructura disponibles en los establecimientos médicos con la información que facilita la caracterización y selección de unidades de atención a la salud mental y consumo de sustancias.
   4. Uso de servicios. Se integró la información de los servicios otorgados en las unidades de salud a lo largo de los últimos 10 años para lo cual se seleccionaron los servicios otorgados en el primer nivel de atención y se clasificaron según su objetivo.

Tras el procesamiento de la información se llevó a cabo la elaboración de los cubos y su transformación para el diseño de la plataforma y visualización geográfica de los indicadores.

II. Estudio exploratorio con entrevista a informantes claves en la captura de información de los usuarios de los y revisión de expedientes. A través del cual se validó el análisis e interpretación de la información contenida en PANGEOS-MX.